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Next Generation Sequencing Technologies And Challenges In Sequence Assembly

Author: Sara El-Metwally
Publisher: Springer Science & Business
ISBN: 1493907158
Size: 69.45 MB
Format: PDF, ePub
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The introduction of Next Generation Sequencing (NGS) technologies resulted in a major transformation in the way scientists extract genetic information from biological systems, revealing limitless insight about the genome, transcriptome and epigenome of any species. However, with NGS, came its own challenges that require continuous development in the sequencing technologies and bioinformatics analysis of the resultant raw data and assembly of the full length genome and transcriptome. Such developments lead to outstanding improvements of the performance and coverage of sequencing and improved quality for the assembled sequences, nevertheless, challenges such as sequencing errors, expensive processing and memory usage for assembly and sequencer specific errors remains major challenges in the field. This book aims to provide brief overviews the NGS field with special focus on the challenges facing the NGS field, including information on different experimental platforms, assembly algorithms and software tools, assembly error correction approaches and the correlated challenges.

Next Generation Sequencing And Sequence Assembly

Author: Ali Masoudi-Nejad
Publisher: Springer Science & Business Media
ISBN: 1461477263
Size: 33.21 MB
Format: PDF, Kindle
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The goal of this book is to introduce the biological and technical aspects of next generation sequencing methods, as well as algorithms to assemble these sequences into whole genomes. The book is organized into two parts; part 1 introduces NGS methods and part 2 reviews assembly algorithms and gives a good insight to these methods for readers new to the field. Gathering information, about sequencing and assembly methods together, helps both biologists and computer scientists to get a clear idea about the field. Chapters will include information about new sequencing technologies such as ChIp-seq, ChIp-chip, and De Novo sequence assembly. ​

Big Data And Differential Privacy

Author: Nii O. Attoh-Okine
Publisher: John Wiley & Sons
ISBN: 1119229049
Size: 26.40 MB
Format: PDF, ePub, Mobi
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A comprehensive introduction to the theory and practice of contemporary data science analysis for railway track engineering Featuring a practical introduction to state-of-the-art data analysis for railway track engineering, Big Data and Differential Privacy: Analysis Strategies for Railway Track Engineering addresses common issues with the implementation of big data applications while exploring the limitations, advantages, and disadvantages of more conventional methods. In addition, the book provides a unifying approach to analyzing large volumes of data in railway track engineering using an array of proven methods and software technologies. Dr. Attoh-Okine considers some of today’s most notable applications and implementations and highlights when a particular method or algorithm is most appropriate. Throughout, the book presents numerous real-world examples to illustrate the latest railway engineering big data applications of predictive analytics, such as the Union Pacific Railroad’s use of big data to reduce train derailments, increase the velocity of shipments, and reduce emissions. In addition to providing an overview of the latest software tools used to analyze the large amount of data obtained by railways, Big Data and Differential Privacy: Analysis Strategies for Railway Track Engineering: • Features a unified framework for handling large volumes of data in railway track engineering using predictive analytics, machine learning, and data mining • Explores issues of big data and differential privacy and discusses the various advantages and disadvantages of more conventional data analysis techniques • Implements big data applications while addressing common issues in railway track maintenance • Explores the advantages and pitfalls of data analysis software such as R and Spark, as well as the Apache™ Hadoop® data collection database and its popular implementation MapReduce Big Data and Differential Privacy is a valuable resource for researchers and professionals in transportation science, railway track engineering, design engineering, operations research, and railway planning and management. The book is also appropriate for graduate courses on data analysis and data mining, transportation science, operations research, and infrastructure management. NII ATTOH-OKINE, PhD, PE is Professor in the Department of Civil and Environmental Engineering at the University of Delaware. The author of over 70 journal articles, his main areas of research include big data and data science; computational intelligence; graphical models and belief functions; civil infrastructure systems; image and signal processing; resilience engineering; and railway track analysis. Dr. Attoh-Okine has edited five books in the areas of computational intelligence, infrastructure systems and has served as an Associate Editor of various ASCE and IEEE journals.

Signale Prozesse Systeme

Author: Ulrich Karrenberg
Publisher: Springer-Verlag
ISBN: 3540273476
Size: 31.24 MB
Format: PDF, ePub
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Buch und CD-ROM bilden ein Lernsystem, welches selbst erforschendes Lernen und die Visualisierung komplexer Vorgänge möglich macht. Das zugrunde liegende didaktische Konzept setzt auf die Visualisierung von Signalen und Prozessen sowie auf die grafische Programmierung signaltechnischer Systeme.

Molekulare Humangenetik

Author: Tom Strachan
Publisher: Spektrum Akademischer Verlag
ISBN: 9783827414939
Size: 54.67 MB
Format: PDF, Docs
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Die vorliegende 3. Auflage der Molekularen Humangenetik ist völlig neu überarbeitet - unter Berücksichtigung der Entdeckungen, die im Zuge und in der Folge des Human Genome Project gemacht wurden. Die einführenden Kapitel (Teil I) beschreiben die Grundlagen wie DNA-Struktur und -Funktion, Chromosomen, Zellen und Entwicklung, Stammbaumanalysen und grundlegende Techniken im Labor. In Teil II werden die verschiedenen Genomsequenzierungsprojekte und die dadurch ermöglichten Einblicke in Organisation, Expression, Variabilität und Evolution des menschlichen Genoms gezeigt. Die Kartierung, Identifizierung und Diagnose der Ursachen von mendelnden und komplexen Krankheiten sowie Krebs ist Schwerpunkt von Teil III. Der letzte Teil gibt Ausblicke auf die funktionelle Genomik und Bioinformatik, auf Tiermodelle und Therapien. Das Buch soll eine Brücke bilden zwischen den grundlegenden Lehrbüchern und der Forschungsliteratur, sodass auch Interessierte mit relativ wenig Hintergrundwissen zum Thema die neuesten Forschungsergebnisse lesen und beurteilen können.

Wirtschaftsinformatik 2005

Author: Otto K. Ferstl
Publisher: Springer-Verlag
ISBN: 3790816248
Size: 54.61 MB
Format: PDF, Kindle
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Die 7. Internationale Tagung Wirtschaftsinformatik 2005 (WI 2005) steht unter dem Leitthema eEconomy, eGovernment, eSociety. Durch dieses Thema kommt der erweiterte Gegenstand der Fachdisziplin Wirtschaftsinformatik zum Ausdruck, der ausgehend von Informationssystemen in Unternehmen zunehmend auch Informationssysteme in öffentlichen Verwaltungen und privaten Haushalten umfasst. Die Beiträge zur WI 2005 greifen folgende Schwerpunkte auf: ERP und SCM, Grid Computing, CRM/SRM, Internet-Ökonomie, eBusiness, Outsourcing, eFinance, IS- und SW-Architekturen, eGovernment, eProcurement, eLearning, Wissensmanagement, Private Services, Ubiquitous Computing, IT-Security, Semantic Web, Information Warehousing, EAI, Mobile Systeme, Softwareagenten. Darüber hinaus enthält der Tagungsband ausgewählte Hauptbeiträge namhafter Autoren. Das Buch richtet sich an Wissenschaftler und Praktiker. Es bietet Orientierungshilfe und einen umfassenden Einblick in die genannten Forschungsfelder.

Vito Volterra

Author: Angelo Guerraggio
Publisher: Springer-Verlag
ISBN: 3034800819
Size: 76.95 MB
Format: PDF, ePub, Mobi
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Der Mathematiker Vito Volterra (1860 – 1940) war nicht nur ein großer Mathematiker, sondern auch ein guter Wissenschaftsorganisator. Über Jahrzehnte galt er als der bedeutendste Repräsentant der Wissenschaft in Italien. Die Autoren rekonstruieren seine wichtigsten Beiträge zur Wissenschaft und zur Entwicklung der wissenschaftlichen Institutionen in Italien und der Welt: von der Entwicklung der Funktionalanalysis über die Untersuchung der Populationsdynamik bis zu seiner Lehrtätigkeit und der Gründung des staatlichen italienischen Forschungsrates.

Algorithmen F R Dummies

Author: John Paul Mueller
Publisher: John Wiley & Sons
ISBN: 3527809775
Size: 35.70 MB
Format: PDF, ePub, Docs
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Wir leben in einer algorithmenbestimmten Welt. Deshalb lohnt es sich zu verstehen, wie Algorithmen arbeiten. Das Buch präsentiert die wichtigsten Anwendungsgebiete für Algorithmen: Optimierung, Sortiervorgänge, Graphentheorie, Textanalyse, Hashfunktionen. Zu jedem Algorithmus werden jeweils Hintergrundwissen und praktische Grundlagen vermittelt sowie Beispiele für aktuelle Anwendungen gegeben. Für interessierte Leser gibt es Umsetzungen in Python, sodass die Algorithmen auch verändert und die Auswirkungen der Veränderungen beobachtet werden können. Dieses Buch richtet sich an Menschen, die an Algorithmen interessiert sind, ohne eine Doktorarbeit zu dem Thema schreiben zu wollen. Wer es gelesen hat, versteht, wie wichtige Algorithmen arbeiten und wie man von dieser Arbeit beispielsweise bei der Entwicklung von Unternehmensstrategien profitieren kann.

Berichte Zur Lebensmittelsicherheit 2005

Author: Peter Brandt
Publisher: Springer Science & Business Media
ISBN: 3764383461
Size: 13.25 MB
Format: PDF, ePub, Docs
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Lebensmittelmonitoring - das von Bund und Ländern durchgeführte Untersuchungsprogramm - ergänzt die amtliche Lebensmittelüberwachung der Bundesländer. Lebensmittelüberwachung kontrolliert die Einhaltung lebensmittelrechtlicher Vorschriften v.a. durch verdachts- und risikoorientierte Untersuchungen. Das Lebensmittelmonitoring hingegen misst und bewertet - wiederholt und repräsentativ - den Gehalt unerwünschter Stoffe (z.B. Pflanzenschutzmittel, Schwermetalle) in und auf Lebensmitteln. Es erkennt Risiken für Verbraucher und stellt sie ab. 2005 wurden 5159 Proben von 50 Lebensmitteln bzw. -gruppen in- und ausländischer Herkunft untersucht.